在明朝天启年间，左都御史杨涟因得罪魏忠贤被冤入狱，其家族被魏忠贤所指使的东厂和锦衣卫所灭门。徐长卿受命救援杨涟孙女杨紫萱，带她逃离追杀，躲入龙泉村的同仁医馆。医馆主刘谦将紫萱视为恩师之后，传授医学，共同经营医馆。但郎中吴南星的嫉妒导致一系列危机，魏忠贤派遣刺客前来杀人灭口。在众人的努力下，成功化解瘟